沉睡万年的超级火山喷发，冲天而起的火山灰盘踞平流层久久不散，彻底遮蔽了大地的阳光。世界坠入永恒长夜，终年寒冬，人类在无边黑暗中艰难求生。
百年之后，一项名为「发芽技术」的实验落地，由萌芽所推广：将濒死之人转化为植株，以此持续制造氧气，维系永夜下的人类存续。数十年间，这项技术也接连引发多起离奇凶案，被世人称作“绿宝石”事件。
在灰雾笼罩的北洛市，张志升和叶嘉琪深陷一桩桩异变案件。他们目睹普通人在异化转变中痛苦挣扎，邂逅困在执念里的钢琴家，牵扯进接二连三的怪物惨案中。随着调查深入，萌芽所隐藏的真相、怪物背后的秘密，缓缓在二人眼前展露一角。
当绿芽从人类躯体破土而生，生命的界限不复存在，人类苦苦坚守的微光，又该如何延续？
