洛特，一位在徒烽王国宫廷斗争中备受排挤与毒害的四王子，在十六岁生日宴上再次中毒后，意外觉醒了“庇护所”权柄，并发现自己真实身份是“魔女”这个世界的非凡者之一。夏洛特的母亲是一位魔女，而他自己因幼年被暗害服下“堕落魔女”魔药，成为了同时拥有魔女与堕落魔女双重非凡力量的男性。
成年礼上，夏洛特被迫再次服用魔药，觉醒出罕见的“数字化”精神力天赋，虽被众人鄙夷为无用，实则拥有超强的运算与建模能力。随后，他离开王宫进入秘银堡炼金高塔学习，开始独立生活。在贫民区爆发诡异死亡事件、夜间遭梦境怪物（小丑）袭击后，夏洛特凭借权柄与觉醒的火焰能力反杀强敌，并获得了非凡结晶。
故事逐步揭示非凡世界的设定：共有十二种正神途径与邪神途径，魔女因自身血肉可作为晋升材料而处境危险，被视为灾厄与悲运的存在。夏洛特作为唯一能生育后代的男性魔女，被母亲视为“魔女的福音”，需庇护所有受迫害的魔女。
与此同时，王兄、王姐与宫相持续谋划将其转化为女性以剥夺继承权；神秘女人渡鸦的遭遇揭示邪教势力威胁；老管家布莱恩与保镖凡纳德等昔日追随者暗中协助夏洛特。他必须在宫廷阴谋、非凡世界的黑暗与个人觉醒中逐步成长，最终肩负起庇护魔女、对抗灵界侵蚀的命运。
