现代法医沈焕，穿成嘉靖末年一介贱籍锦衣卫小旗。在这个权宦当道、波谲云诡的深宫，他身怀一个不能言说的秘密：每夜子时，可与命案现场的亡灵对话一分钟。
他本想借此在夹缝中求生，并查清父亲冤案。然而，一具诏狱白骨的低语，却将他拖入更深的漩涡。凭借对骨骼伤痕的现代解读与亡灵提供的碎片线索，他于公堂之上上演“白骨断案”，以无可辩驳的痕检逻辑让真凶伏法，却也触碰到了名为“红莲会”的邪教组织。
此后，沈焕被卷入更诡谲的“科举幽灵案”。鬼影幢幢的考场，举子接连暴毙。在侦破精密舞弊阴谋的同时，他发现所有线索竟都指向“红莲会”一个更疯狂的目标：在皇家祭典上，伪造“天谴”，弑君篡国！
当阴谋逼近顶点，敌人以邪术干扰阴阳，沈焕的“亡灵低语”彻底失效。在没有任何亡灵指证的绝境下，他唯一能依靠的，只剩下来自现代的 forensic mind（法证思维）。最终，他必须在帝王与百官面前，以现场遗留的一撮特殊火药、一道隐秘的财务流向、一连串严丝合缝的行为逻辑，完成一场没有证人的审判，用绝对的理性，撕开笼罩皇权的迷信假面。
夜行锦衣，通幽断案。他为沉默的死者言，以逻辑为剑，剖开最诡谲的迷局。
