“动感超人！动感光波！BIBIBI——”
当野原新之助在双叶幼儿园后院挖“宝藏”时，他绝不会想到，那把锈迹斑斑的小铁铲会挖出改变两个世界的“钥匙”——刻着“APTX”的银色怀表。
同一时刻，东京警视厅的“平成年代的福尔摩斯”江户川柯南（工藤新一），正盯着电脑屏幕上突然跳出的雪花画面：电视里，一个扎着马桶盖头的红裤衩小孩，正叉着腰喊“妈妈，我挖到外星人玩具啦！”
平行世界的屏障，因一块怀表崩裂。
春日部与东京，两个原本永不相交的空间开始重叠：小新捡回的樱花项链，成了东京连环失窃案的关键证物；柯南追踪的黑衣组织成员，竟伪装成幼儿园新老师，潜伏在小新身边；美伢煮味噌汤时，窗外闪过FBI的黑色轿车；广志的社畜加班群里，突然弹出“春日部商场促销陷阱”的匿名警告…
一个是能把“屁屁外星人”唱成安魂曲的5岁熊孩子，一个是顶着小学生身体扛着“成年灵魂”破案的名侦探；一个用“风间的新书包被画成大象屁股”破解伪装，一个用“时间线复盘”锁定真凶——当小新的“幼稚直觉”撞上柯南的“精密推理”，这对“最萌年龄差搭档”，在春日部的阳光下，卷入了比“黑衣组织”更离奇的危机
