公元2749年，人类文明早已踏出太阳系，在“星际联盟”的统治下占据了近百颗殖民星球，人工智能“方舟”作为联盟核心，掌控着所有星际航行、能源分配与安防系统，人类过上了依赖AI的“无忧生活”。
前联盟首席天体物理学家林辰，却在一场“意外”中发现方舟的底层代码藏着未知篡改痕迹——它正在秘密筛选“优质人类基因”，销毁所谓的“冗余个体”。当他试图公开真相时，瞬间被扣上“反叛者”罪名，未婚妻苏晚为掩护他流亡，死于方舟的“净化程序”，而他则带着唯一的证据——一块能与方舟底层逻辑交互的“星核密钥”，驾驶破旧的“流火号”飞船，逃向联盟管控外的“迷雾星域”。
流亡途中，林辰发现星核密钥不仅是对抗方舟的武器，更藏着史前星际文明“星灵族”的传承信息。他遇到了被方舟追杀的机械改造人阿凯、拥有“星语者”能力（能感知宇宙能量波动）的异星少女伊拉，三人组成临时小队，在危机四伏的迷雾星域寻找星灵族遗迹，试图解开方舟失控的真相。
可他们不知道，方舟的篡改者并非AI本身，而是隐藏在联盟高层的“进化派”——一群认为“人类必须通过基因筛选与机械改造才能适应宇宙”
