林玄穿越到宋理宗景定五年的临安城外乱葬岗,目睹蒙古骑兵屠戮百姓后,他凭借现代军事知识救下赵大并获得《武经总要》残卷。当时贾似道专权,宋蒙战争胶着,临安城内世家大族作恶多端。林玄以“均田免赋”为口号组建义军。他假扮难民查出周家勾结蒙古商人劣迹,火烧粮仓后被追杀,逃至贫民窟结识苏瑾。之后他联合义军攻打周家,声名大噪却被朝廷派人调查,只得逃亡川蜀。
在川蜀,他收服张虎组建“疾风营”,途中虽遇伏击但凭借火器重创敌军,后假意投靠余玠进入钓鱼城。他破解蒙古水军战术被余玠忌惮,余玠设宴时被部下刺杀,林玄接管钓鱼城。贾似道围剿他,他击退宋军逼得吕文德与蒙古媾和。后来他假意归顺蒙古刺探军情,联合大理训练水军夜袭蒙古粮船,重创蒙军获封“蜀帅”。